Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcho1Q8K285 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fcho1Q8K285 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms