Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms