Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LgsnQ8CIX8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms