Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGU1

Calcoco1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco1Q8CGU1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calcoco1Q8CGU1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calcoco1Q8CGU1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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