Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC4

Lsm14b, Protein LSM14 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm14bQ8CGC4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm14bQ8CGC4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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