Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setd1bQ8CFT2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms