Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hpf1Q8CFE2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms