Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ercc8Q8CFD5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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