Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms