Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms