Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms