Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Lrif1Q8CDD9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Lrif1Q8CDD9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Lrif1Q8CDD9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Lrif1Q8CDD9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Lrif1Q8CDD9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Lrif1Q8CDD9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Lrif1Q8CDD9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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