Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8CC96 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8CC96 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8CC96 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8CC96 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8CC96 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8CC96 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8CC96 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CC96 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms