Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm16223Q8CBM3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm16223Q8CBM3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm16223Q8CBM3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm16223Q8CBM3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm16223Q8CBM3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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