Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms