Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slfn5Q8CBA2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms