Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4aQ8C9S8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Atg4aQ8C9S8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4aQ8C9S8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4aQ8C9S8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4aQ8C9S8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4aQ8C9S8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4aQ8C9S8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Atg4aQ8C9S8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Atg4aQ8C9S8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4aQ8C9S8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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