Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms