Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc187Q8C5V8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc187Q8C5V8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc187Q8C5V8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc187Q8C5V8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ccdc187Q8C5V8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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