Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Trim35Q8C006 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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