Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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