Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod1Q8BVA4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod1Q8BVA4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms