Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep55Q8BT07 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep55Q8BT07 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms