Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ3

Bnc2, Zinc finger protein basonuclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc2Q8BMQ3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bnc2Q8BMQ3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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