Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms