Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra5Q8BHJ7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra5Q8BHJ7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra5Q8BHJ7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra5Q8BHJ7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra5Q8BHJ7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra5Q8BHJ7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra5Q8BHJ7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra5Q8BHJ7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra5Q8BHJ7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra5Q8BHJ7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra5Q8BHJ7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra5Q8BHJ7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra5Q8BHJ7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra5Q8BHJ7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabra5Q8BHJ7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra5Q8BHJ7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms