Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE4

Susd6, Sushi domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd6Q8BGE4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd6Q8BGE4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms