Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms