Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms