Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crb2Q80YA8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms