Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Zbed4Q80WQ9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Zbed4Q80WQ9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Zbed4Q80WQ9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Zbed4Q80WQ9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed4Q80WQ9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Zbed4Q80WQ9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Zbed4Q80WQ9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Zbed4Q80WQ9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Zbed4Q80WQ9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Zbed4Q80WQ9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Zbed4Q80WQ9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms