Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnupnQ80W37 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms