Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmcc2Q80W04 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmcc2Q80W04 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms