Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
AknaQ80VW7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AknaQ80VW7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms