Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lrrc1Q80VQ1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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