Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2eQ80UW8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms