Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms