Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms