Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms