Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms