Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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