Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Scn4bQ7M729 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Scn4bQ7M729 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Scn4bQ7M729 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Scn4bQ7M729 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Scn4bQ7M729 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Scn4bQ7M729 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Scn4bQ7M729 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scn4bQ7M729 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scn4bQ7M729 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scn4bQ7M729 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scn4bQ7M729 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scn4bQ7M729 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scn4bQ7M729 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Scn4bQ7M729 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn4bQ7M729 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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