Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms