Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed3Q78IS1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms