Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps27Q6ZWU9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps27Q6ZWU9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms