Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SpopQ6ZWS8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms