Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne2Q6ZWQ0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne2Q6ZWQ0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms