Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scaf4Q6PFF0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scaf4Q6PFF0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms