Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SvoplQ6PDF3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SvoplQ6PDF3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SvoplQ6PDF3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SvoplQ6PDF3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SvoplQ6PDF3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SvoplQ6PDF3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SvoplQ6PDF3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SvoplQ6PDF3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SvoplQ6PDF3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SvoplQ6PDF3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SvoplQ6PDF3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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