Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trak1Q6PD31 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms